| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GAATTAAGCCACATGCAGCTGTATATTGGCGCAGCACTTTCCGCCATTCTGGTTCTGTTTACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCC > NC_010473/3199270‑3199666 | gAATTAAGCCACATGCAGCTGTATATTGGCGCAGCACTTTCCGCCATTCTGGTTCTGTTTACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGgcgc > 1:18576S7/1‑200 (MQ=255) aaccacactGCAGCTGTATATTGGCGCAGCACTTTCCGCCATTCTGGTTCTGTTTACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACGGCCGACGAATCAGAGCTGGACAAAGCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑tgat > 1:9585S80/9‑200 (MQ=255) 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gcaggcgcatcaagctgtgtcgcAGCACTTTCCGCCATTCTGGTTCTGTTTACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCT‑‑TCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑ccc > 1:26509S1/21‑200 (MQ=255) agcccttacgtttggtacacttttcggtaaagctggctgaggccgttttattgacggcgtgtttgctgcgagttttggcgtttttagaagcggtaatggaagattttttaacggaagaagcggttttgcttttggtagtacttttactggcggcttttttcgctgttttctgggtctttttggtggttgccgtgctC‑tga > 1:31183S52‑M2/197‑200 (MQ=255) gcttgtacttcgtgcagcaCTTTCCGCCATTCTGGTTCTGTTTACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATg > 1:31324S1/14‑200 (MQ=255) cgtttggtacacttttcggtaaagctggctggagccattttatcgacggcgtgtttgctgcgagttttggcgtttttagaagcggtaatggaagattttttaacggaagaagcggttttgcttttggtcgtacttttactggcggcttttttcgctgttttctgggtctttttggtggttgccgtgctC‑TGATG‑AAT‑ccc > 1:23930S8‑M2/189‑200 (MQ=255) acgtttggtacacttttcggtaaagctggctgaggccgttttattgacggcgtgtttgctgagtttggcgtttttagaagcggtaatggaagattttttaacggaagaagcggttttgcttttggtcgtacttttactggcggcttttttcgctgttttctgggtctttttggtggttgccgtgctC‑TGATG‑AAT‑CCCCt > 1:3917S38‑M2/187‑200 (MQ=255) ttggtacacttttcggtaaagctggctgaggccgttttattgacggcgtgtttgctgcgagttttggcgtttttagaagcggtaatggaagattttttaacggaagaagcggttttgcttttggtcgtacttttactggcggcttttttcgctgttttctgggtctttttggtggttgccgtgctC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑a < 1:2945S1‑M2/15‑1 (MQ=255) tttggtacacttttcggtaaagctggctgaggccgttttattgacggcgtgtttgctgcgagttttggcgtttttagaagcggtaatggaagattttttaacggaagaagcggttttgcttttggtcgtacttttactggcggcttttttctgttttctgggtctttttggtggttgccgtgctC‑TGATg‑gat‑ccctaat < 1:27975S38‑M2/16‑5 (MQ=255) ttccaccaccgcatccagcaaccgcattgcgaccgccatatcgctcggatgggtggcaatgcaggcttcgcttacgcctaccaccgcgtgctgacggctaaagccttcaagcgccgcgcagccgctcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATg > 1:4469S40‑M2/183‑200 (MQ=255) 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ggTTCTGTTTACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAACGTATGGCAATTTTCTCTCATCTTCTCAA‑TGCTGCTGG‑CGCCTGATG‑AAT‑CCCCTGAATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGa < 1:5921S69/200‑1 (MQ=255) cTGTTTACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATAcaca > 1:23171S5/1‑200 (MQ=255) ttattgacggcgtgtttgctgcgagttttggcgtttttagaagcggtaatggaagattttttaacggaagaagcggttttgcttttggtcgtacttttactggcggcttttttcgctgttttctgggtctttttggtggttgccgtgctC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATa < 1:12834S309‑M2/51‑1 (MQ=255) cgccatatcgctcggatgggtggcaatgcaggcttcgcttacgcctaccaccgcgtgctgacggctaaagccttcaagcgccgcgcagccgctccctggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TAATG‑‑AT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATac < 1:30547S3‑M2/51‑1 (MQ=255) tttACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑t < 1:18608S140/200‑1 (MQ=255) tACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAAATGCCGCCGGGCGC‑TGATGTCAG‑CCCCC‑TATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑t < 1:11114S22/200‑1 (MQ=255) tACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTg > 1:27310S5/1‑200 (MQ=255) tatcgctcggatgggtggcaatgcaggcttcgcttacgcctaccaccgcgtgctgacggctaaagccttcaagcgccgcgcagccgctcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaatagggggcagcgcgC‑TGATG‑AATCCCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATacac < 1:32734S9‑M2/55‑1 (MQ=255) catatcgctcggatgggtggcaatgcaggcttcgcttacgcctaccaccgcgtgctgacggctaaagccttcaagcgccgcgcagccgctcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaatagggcagcgcgC‑TGATG‑‑AT‑CTC‑‑‑GATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑t < 1:17840S21‑M2/55‑1 (MQ=255) atcgctcggatgggtggcaatgcaggcttcgcttacgcctaccaccgcgcgccgacggtgaaagccttcaagcgccgcgcagccgctcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑t < 1:27271S33‑M2/56‑1 (MQ=255) cTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATAcacactctgtcat < 1:25521S31/200‑10 (MQ=255) cggatgggtggcaatgcaggcttcgcttacgcctaccaccgcgtgctgacggctaaagccttcaagcgccgcgcagccgctcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑a > 1:24214S27‑M2/138‑200 (MQ=255) 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ctaaagccttcaagcgccgcgcagccgctcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaattgggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACt > 1:32699S4‑M2/83‑200 (MQ=255) ctgGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCGATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGatat > 1:30303S18/1‑200 (MQ=37) tgGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATAtt > 1:10105S2/1‑200 (MQ=37) gggCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATAttt < 1:20688S25/200‑1 (MQ=37) cTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGCCG‑AAAAATC‑AATAATCAG‑‑‑‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑g > 1:11339S47/1‑200 (MQ=25) agcgccgcgcagccgctcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATAtttt > 1:22619S16‑M2/74‑200 (MQ=255) gccgctcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCC‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GActct‑c < 1:3223S136‑M2/138‑1 (MQ=255) tcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑‑‑‑CATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCaa < 1:12082S6‑M2/143‑1 (MQ=255) tcccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaatagggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCTGAATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTAc < 1:16124S53‑M2/144‑1 (MQ=255) gTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAACG‑‑GTTTTGC‑GCAAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGTGAACT‑CAATATTT‑ACAC‑CACTCT‑C‑TTTAcctgt < 1:21340S6/200‑4 (MQ=255) ccgggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCa < 1:8957S25‑M2/145‑1 (MQ=255) tttactggcggcttttttcgctgttttctgggtctttttggtggttgccgtgctC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATTCTTTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTAcc > 1:8396S14‑M2/55‑200 (MQ=255) ttAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTc > 1:10130S37/1‑200 (MQ=34) ggcaggcgcttattgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAAtt > 1:11867S54‑M2/53‑200 (MQ=255) a‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑cccc < 1:22710S2/200‑1 (MQ=34) aGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCGATTCtaccgaatt > 1:1659S7/1‑192 (MQ=21) ttttttcgctgttttctgggtctttttggtggttgcggcgctC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGaa < 1:26957S6‑M2/158‑1 (MQ=255) caagcgtatggcattt‑ttATCTTCTCAA‑TGCCGCCGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAAtt < 1:20063S101/185‑1 (MQ=17) ttgcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATTATTAAAATGAAGTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGa < 1:8349S10‑M2/160‑1 (MQ=255) tcagggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTac > 1:23760S1‑M2/39‑200 (MQ=255) agggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCG‑ACTCCGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTacac > 1:10006S32‑M2/37‑200 (MQ=255) ggctgattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑GAATA‑TTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTa > 1:29428S26‑M2/35‑200 (MQ=255) gcgggctggtcagtttcgaaattggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACTCCGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACt > 1:22010S1‑M2/35‑200 (MQ=255) ctgttttctgggtctttttggtggttgccgtgctC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACtt > 1:26152S2‑M2/35‑200 (MQ=255) gattggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGT‑CAT‑‑ACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑GG‑‑ATGTTACAC‑GACTCT‑C‑‑TTACCAATTCTGCCCCCGAATTACACTTAAAACGACt > 1:13222S9‑M2/31‑200 (MQ=255) ggtgtcgtaaaaataggggcagcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGAc > 1:14590S11‑M2/27‑200 (MQ=255) tttttggtggttgccgtgctC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACa > 1:18764S19‑M2/21‑200 (MQ=255) taaaaataggggcagcgcgC‑TGATA‑GAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CAATA‑TTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑‑CCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCt > 1:20618S30‑M2/20‑200 (MQ=255) ctcAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑ATT‑CCTGC‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑C‑ATTCTTTACAT‑GA‑TCTTC‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCtt < 1:26923S2/200‑1 (MQ=17) aa‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTaa < 1:29070S11/200‑1 (MQ=32) tggttgccgtgctC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑A‑ATCA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACg < 1:17116S9‑M2/187‑1 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1:28287S28/200‑1 (MQ=17) gcgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTCAATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCt < 1:9037S23‑M2/195‑1 (MQ=255) cgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑‑CCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGc > 1:17392S7‑M2/5‑200 (MQ=255) cgcgC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCA‑ACACAAAATATGTGCGAACT‑C‑ATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGc < 1:22275S59‑M2/196‑1 (MQ=255) | GAATTAAGCCACATGCAGCTGTATATTGGCGCAGCACTTTCCGCCATTCTGGTTCTGTTTACCCTGACTCTGCCGCATATTCCGGTTGCTAAACAGCAAGCGAATCAGAGCTGGACAA‑CCCTGCTGGGCCTCGATGCA‑‑TTCGCGCTGTTTAAAAA‑CAAGCGTATGGCAATCTTCT‑TTATCTTCTCAA‑TGCTGCTGGGCGC‑TGATG‑AAT‑CCCCT‑AATGATTTT‑GGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACA‑TC‑TTGTC‑ATATGA‑TCAAATG‑‑GTTTCGC‑G‑AAAAATC‑AATAATCAGACA‑ACAAGATGTGCGAACT‑CGATATTTTACAC‑GACTCT‑C‑TTTACCAATTCTG‑CCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCC > NC_010473/3199270‑3199666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 48 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |