New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_010473 | = 1380530 | 0 (0.000) | 14 (0.600) +GGGGATCCGTCGACCTGCAGTTCGAAGTTCCTATTCTCTAGAAAGTATAGGAACTTCGAAGCAGCTCCAGCCTACACA |
13/242 | 1.1 | 58.2% | coding (91/612 nt) | lacA | galactoside O‑acetyltransferase |
? | NC_010473 | = 4471165 | 33 (0.860) | intergenic (+109/‑29) | groL/yjeI | chaperonin GroEL/DUF4156 domain‑containing protein |
TGGTTACCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAG‑‑AGT‑‑GCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAG > NC_010473/4470968‑4471354 | tGGTTACCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAAATCAA‑‑‑CGAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑ATTT‑GGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtg < 1:1227S36‑M2/200‑3 (MQ=255) ggTTACCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTTA‑CTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTcc < 1:1204S21/200‑1 (MQ=255) aCCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTT‑GGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtagg < 1:1058S79‑M2/200‑9 (MQ=255) aCCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACC‑CTCAGGAAAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCCC‑CCAGGGGATTGCTGAGATT‑CTTTTGGTCATCTTTCTCATCTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGctgt > 1:475S32/1‑197 (MQ=255) ccTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGG‑TTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctgga > 1:3923S1‑M2/1‑187 (MQ=255) cTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctgga > 1:10881S1‑M2/1‑187 (MQ=255) gCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CGAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtggctggagctgc < 1:27534S37‑M2/200‑16 (MQ=255) gCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGT‑TGGGGGTTTTT‑CTTTTCGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGAtt < 1:10092S11/200‑1 (MQ=255) cGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTT‑GGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTAt > 1:4782S2/1‑200 (MQ=255) cGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑A‑TGTGTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTGATTGATTAt > 1:4613S67/1‑200 (MQ=255) aaaaaCGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAGGAGAATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTa > 1:18615S11/1‑200 (MQ=255) aaaCGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttc < 1:10755S48‑M2/200‑22 (MQ=255) cGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTAGTGGGCGGCATCGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcga < 1:19473S23‑M2/200‑24 (MQ=255) cGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaa < 1:25727S72‑M2/200‑25 (MQ=255) tGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagtt > 1:10777S9‑M2/1‑173 (MQ=255) gACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCAc < 1:26947S27/200‑1 (MQ=255) tAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGG‑CAG‑A‑A‑‑‑TCTGTAAGATTGT‑‑‑TTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagaga < 1:6967S21‑M2/200‑45 (MQ=255) gcgcTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATCGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACGGGCGCAGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑aa < 1:4528S3/200‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑A‑TGTCTGGGGGTTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTGA‑GTAT‑TAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CC‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑aaata > 1:2641S19/1‑198 (MQ=255) ggCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CGAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctcgaatcagaa < 1:16032S8‑M2/200‑50 (MQ=255) gCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAg > 1:1980S32/1‑200 (MQ=255) a‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AA‑‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGG‑‑‑‑‑‑‑CTTT‑GGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGc < 1:6417S57/200‑1 (MQ=255) ggatggggTGGCATGGGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACAGTGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACtatggatggcgggttg < 1:12247S32/195‑16 (MQ=255) cATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagataggaacttcgaactgcaggt < 1:2824S5‑M2/200‑64 (MQ=255) ggTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑ATC‑GAA‑‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTAAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctggatactcagaactcgaactgcaggtcga < 1:10240S39‑M2/200‑69 (MQ=255) ggCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGTCAGCATGCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCt > 1:12872S23/1‑200 (MQ=255) ggCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTT‑‑‑‑‑TTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATA‑CATG‑‑TG‑‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGc < 1:10107S31/200‑1 (MQ=255) cATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCA‑GTGCAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACt < 1:24973S39/200‑1 (MQ=255) aTGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttccatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggat > 1:19300S47‑M2/1‑127 (MQ=255) gg‑cggcATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑G‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATg > 1:16892S20/1‑200 (MQ=255) g‑cggcATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAAAAACAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGa > 1:32418S7/1‑200 (MQ=255) tgTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaat > 1:6568S2‑M2/1‑114 (MQ=255) tgTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTa < 1:1327S40/200‑1 (MQ=255) tgTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTT‑GGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAg > 1:4128S39/1‑200 (MQ=255) tgTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCC‑GGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTTT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAg > 1:26829S72/1‑200 (MQ=255) aTTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTc > 1:26876S91/1‑200 (MQ=255) gCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAg > 1:5020S63/1‑200 (MQ=255) aG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AAT‑ACTGGGGGTTTTT‑‑ATTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTGATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGtg‑‑‑‑‑ct > 1:5302S5/1‑200 (MQ=255) aaa‑‑‑caaacCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑TGGACTGACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGcc < 1:3465S32/200‑1 (MQ=255) a‑‑‑caaacCCC‑GGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTc > 1:11167S43/1‑200 (MQ=255) caaacCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagattcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcag < 1:693S35‑M2/200‑117 (MQ=255) ccccGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAgt < 1:28516S38/200‑1 (MQ=255) gggCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑G‑GTGTCAGGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTa > 1:27365S102/1‑200 (MQ=255) ggCAG‑A‑AATGTCTGGGG‑TTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaa > 1:3673S16‑M2/1‑73 (MQ=255) a‑aaTGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagaga > 1:27182S32‑M2/1‑69 (MQ=255) aTGTCTGGGGGTTTTT‑ATTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTACGCATtgtg > 1:21154S2/1‑200 (MQ=255) gTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagtcgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggattcccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagc > 1:18573S2‑M2/1‑65 (MQ=255) tCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtggacgaaattacacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgcc < 1:28288S23‑M2/200‑157 (MQ=255) tcatcttat‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAG‑‑AGT‑‑Gc > 1:22848S61/9‑200 (MQ=255) tCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAAACGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAG‑‑AGT‑‑Gcc < 1:13762S30/200‑1 (MQ=255) tttCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑C‑AATTGGGTGTATTTTTACCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAG‑‑AGT‑‑Gc > 1:16691S18/1‑200 (MQ=255) ctagt‑aagatTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgccacggtagggg < 1:31575S1‑M2/196‑167 (MQ=255) aGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgccacggtaggggaaaacgcctggg > 1:27006S17‑M2/1‑22 (MQ=255) a‑cGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggcagcccgcttcaaagtccagattcgagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgccacggtaggggaaaacgcctggtagaacc > 1:31093S199‑M2/1‑18 (MQ=255) a‑cGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGGGAGTTTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACa > 1:12199S183/1‑200 (MQ=255) a‑cGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACT‑AGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAG‑‑AGT‑‑GCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTaa > 1:20554S56/1‑200 (MQ=255) cGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgatgaattcgctatgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgccacggtagggaaacgcctgggtagaac > 1:19201S48‑M2/1‑17 (MQ=255) gac‑gacG‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttgaagttcctatactttctagagaataggaacttcaaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgccacggtaggggaaaacgcctggggtagaacc < 1:29173S9‑M2/200‑186 (MQ=255) ac‑gacg‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgctggaagccctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtacgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgccacggtaggggaaaacgctgggtagaaccgcct < 1:20877S24‑M2/200‑187 (MQ=255) acg‑‑CG‑AGT‑GGCtgtgtaggctggagctgcttcaaagtcctatactttctagagaataggaacttcaaactgttagtgagacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgccacggtaggggaaaacgctgagggtagaaccgcc < 1:27158S2‑M2/200‑190 (MQ=255) acg‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAG‑‑AGT‑‑GCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTaagcaaag < 1:9417S31/200‑1 (MQ=255) gCtgtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccacgttaatgtatgagtttaatcactcgcatccatcagaagttgaaaaaagagaaagcctgattaaagaaatgtttgccacggtaggggaaaacatgggtagaaccgcctgtctatttctc < 1:19968S17‑M2/200‑199 (MQ=255) | TGGTTACCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTA‑TGGGCGGCATGGGTGGCATGGG‑CGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAG‑‑AAA‑TAAA‑‑‑CAAACCCCCGGGCAG‑A‑AATGTCTGGGGGTTTTT‑CTTTTGGTCATCTTTCT‑A‑GTAT‑AAGATTCAGACA‑CGGAC‑GACG‑‑CG‑AGT‑GGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGT‑AAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAA‑CGAATTGAGTG‑‑‑‑‑CTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAG‑‑AGT‑‑GCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAG > NC_010473/4470968‑4471354 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 48 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |