New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_010473 | = 321143 | NA (NA) | pseudogene (264/264 nt) | ECDH10B_RS23575 | acetyltransferase |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TCTTTTTTGGCTGTTGCCGACCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGAACCAA‑CTTA‑TATATTTTT‑GAG‑TACAGCTT‑‑GGCCTCAGCATTACGCC‑GATGGGTATACACTGTCTTCACACTACAATTTTCAATT‑CTGGCAATCGATTTA‑GGTTGCATTCCCTGGGCCGTCATGCGGATAATTT‑CCATTTCCCGGTCCGTGATTTTATCTTTCTTAATATCTTTTCTCAGGAACCTGCCATTAATCAC > NC_010473/285327‑285723 | tCTTTTTTGGCTGTTGCCGACCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGa > 1:29545S60/1‑200 (MQ=255) ttttttGGCTGTTGCCGACCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTT‑‑‑AC‑‑GAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGgatttg < 1:4170S9‑M1/200‑7 (MQ=255) ttttGGCTGTTGCCGACCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTT‑AAAAC‑‑TAACTTTC‑CTGGAGTTTAC‑TGAACCaa > 1:23664S10/1‑200 (MQ=255) ttttGGCTGTTGCCGACCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTT‑‑CGTT‑‑‑AACTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGAACCAA‑Ct > 1:23705S41/1‑200 (MQ=255) ggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaacttggtctttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAC‑TGa < 1:14708S7‑M1/8‑1 (MQ=255) cTGTTGCCGACCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCC‑GAACC‑‑‑TTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACT‑‑C‑CTGGAGTTTACTTGgacttgcccctatat > 1:15165S22‑M1/1‑185 (MQ=255) ttGCCGACCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGAACCAA‑CTta‑tata > 1:19391S43/1‑200 (MQ=255) gCCGACCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGAACCAA‑CTTA‑TATAtt > 1:6270S35/1‑200 (MQ=255) gccagcaggtcGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGgatttgcccctatattt > 1:27861S1‑M1/6‑183 (MQ=255) aCCAGGTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATTCGAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGA‑CCAA‑cgataaaattttga < 1:184S10/200‑14 (MQ=255) ggTCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑TTTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGAACCAA‑CTTA‑TATAttttttgagt > 1:29027S10/1‑195 (MQ=255) tCGCTACAGCCTGAGCTGTTACGTCAGCAGCCTGCGCCACACCCATGCCGGTAAACACCGTTACCAGAGCTATTGCCAGAACC‑‑TTTTTTT‑CATTGC‑ATTTCTT‑CCCGAGTTGAATT‑GAGGACGTGATGTCCCAGTGAGTCATTTTTTAAAAC‑‑TAACTTGC‑CTGGAGTTTAC‑TGgatttgcccctatatttccagacatct > 1:26060S21‑M1/1‑173 (MQ=255) caaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAC‑TGAACCAA‑CTTA‑TATATTTTT‑GAG‑t < 1:30509S4‑M1/30‑1 (MQ=255) aaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAC‑TGAACCAA‑CTTA‑TATATTTTT‑GAG‑Ta > 1:5025S10‑M1/170‑200 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 48 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |