| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_010473 | = 306759 | 38 (0.990) | 46 (1.200) | 40/398 | 0.1 | 54.8% | intergenic (+109/‑386) | ECDH10B_RS25865/pdeL | protein YahV/DNA‑binding transcriptional activator/c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeL |
| ? | NC_010473 | 3211929 = | NA (NA) | pseudogene (1/603 nt) | nupG | nucleoside permease NupG | |||||
GGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_010473/306563‑306759‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTG > NC_010473/3211929‑3212124 GGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTG < 1:19968S173/200‑1 TTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TC > 1:29547S5/1‑200 TTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TC > 1:26662S53/1‑200 TCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCC < 1:5366S25/200‑1 TGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑GATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAAT < 1:3481S45/200‑1 GTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATG < 1:22690S27/200‑1 TGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAAT‑‑GTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATT > 1:9378S9/1‑200 TATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAA > 1:25430S22/1‑200 TTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATGCGTTGTGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATCTGCTGATGAACA‑TCCCCTAATAATTTatcaaa > 1:11619S6/1‑194 AATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCA > 1:3513S63/1‑200 AATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑A < 1:29288S62/200‑1 TATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑GTTTCATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑‑‑TTCCTGAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGG < 1:1354S19/200‑1 TATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGG > 1:1781S28/1‑200 TTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTTCTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GG‑AC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTA < 1:28055S9/200‑1 TGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGT‑ATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA > 1:22683S65/1‑200 ATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAAAGGGACTGA‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TAC < 1:30862S10/200‑1 GCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTA‑‑GGGAA‑‑ACAACACAAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCT < 1:17698S10/200‑1 GCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCAT < 1:30076S1/200‑1 GCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑CTCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCAT < 1:22170S86/200‑1 TGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAA > 1:11752S32/1‑200 AATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTTTATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATAAATAAATGGTTTCGCCAAAAA‑T > 1:19667S5/1‑200 TTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTACA‑ATCA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAAT > 1:28976S4/1‑200 TTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATAGAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAAT > 1:23015S6/1‑200 ATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAA > 1:11258S56/1‑200 GGTTTTTAA‑GGG‑C‑‑A‑GGC‑‑‑AGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAA < 1:22718S44/200‑1 TTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAA < 1:1629S2/200‑1 TTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACT > 1:17281S136/1‑200 GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATGAGT‑ATGCATAACCAACATCT‑‑ACTTCATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATA > 1:28134S16/1‑200 GAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑AATAc > 1:12448S33/1‑199 A‑GGCA‑TAGAGTAATGATAGGT‑CTGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATAATCAAATCGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTT > 1:17876S2/1‑200 TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTAGGAGGTTGA‑TACA‑CATA‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTA > 1:1339S93/1‑200 AGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑ACTCCCTGAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACtac < 1:19674S73/200‑4 GTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTC > 1:5896S1/1‑200 AATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTC > 1:31093S44/1‑200 GATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTT > 1:4017S13/1‑200 GATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATCTAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCAGATGATCAAATGGTTTTGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTT < 1:12863S47/200‑1 CAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGA > 1:5801S25/1‑200 ACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCC‑AACGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATT < 1:14733S5/200‑1 CATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAAT < 1:4438S15/200‑1 TCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTAC < 1:2311S3/200‑1 TT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACG > 1:312S65/1‑200 GAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTGAAACGACTCAACAGC < 1:19759S1/200‑1 GAATGTTGACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGT‑GAGTGCA‑C‑‑ATTCTCTTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAA > 1:29229S69/1‑200 ACGCTATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATTATTAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCTAGTTCTCATATTTTACACTACT‑TCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTT < 1:12208S10/200‑1 CGCTATGTGCTGATCA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TAGAGC‑‑A‑‑‑TGTT‑AAGATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTT < 1:13000S10/200‑1 ATGTGCTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACATGACT‑TCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTG < 1:26759S23/200‑1 GGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGT‑CTTAATGAGTGGGTTTTTAA‑GGGAC‑‑A‑GGCA‑TAGAGTAATGATACGT‑ATGCATAACCAACATCTTTACT‑CATT‑ATGTCATTGAATGTTGACGCTATGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_010473/306563‑306759‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGATGA‑‑A‑TCCCCTAATGATTTTT‑ATCAAAATCATTAAGTTA‑‑AGGTAGA‑TACA‑C‑‑A‑‑‑TCTT‑GTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAA‑TCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTC‑GATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTG > NC_010473/3211929‑3212124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 47 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |